Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gjb1P28230 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms