Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BrafP28028 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BrafP28028 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BrafP28028 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BrafP28028 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BrafP28028 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BrafP28028 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BrafP28028 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BrafP28028 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BrafP28028 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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