Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lef1P27782 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Lef1P27782 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms