Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CftrP26361 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CftrP26361 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CftrP26361 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CftrP26361 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CftrP26361 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms