Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ChgaP26339 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChgaP26339 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms