Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax3P24610 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms