Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZfaP23607 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZfaP23607 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZfaP23607 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZfaP23607 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ZfaP23607 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZfaP23607 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZfaP23607 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZfaP23607 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZfaP23607 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZfaP23607 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms