Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tsta3P23591 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tsta3P23591 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tsta3P23591 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Tsta3P23591 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tsta3P23591 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms