Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkchP23298 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkchP23298 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkchP23298 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms