Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PparaP23204 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PparaP23204 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PparaP23204 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PparaP23204 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PparaP23204 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PparaP23204 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms