Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RarbP22605 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RarbP22605 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RarbP22605 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RarbP22605 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RarbP22605 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RarbP22605 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RarbP22605 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms