Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gna11P21278 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gna11P21278 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms