Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnnc2P20801 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms