Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ms4a2P20490 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms