Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pou5f1P20263 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou5f1P20263 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms