Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rpl13aP19253 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms