Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PcnaP17918 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PcnaP17918 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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