Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa-rs2P17534 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.2 ms