Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tgfb3P17125 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms