Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ass1P16460 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ass1P16460 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms