Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rag1P15919 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms