Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd44P15379 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd44P15379 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms