Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PrphP15331 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PrphP15331 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PrphP15331 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PrphP15331 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms