Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmnb1P14733 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmnb1P14733 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms