Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Srp54P14576 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Srp54P14576 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Srp54P14576 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srp54P14576 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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