Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rb1P13405 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms