Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CatspereP0DP43 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CatspereP0DP43 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms