Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Becn2P0DM65 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Becn2P0DM65 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms