Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprqP0C5E4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprqP0C5E4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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