Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc8P09025 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms