Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NefmP08553 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefmP08553 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefmP08553 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefmP08553 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms