Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chrna1P04756 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chrna1P04756 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms