Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H2-Eb1P04230 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-Eb1P04230 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms