Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tgfb1P04202 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgfb1P04202 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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