Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P01789 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01789 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01789 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01789 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms