Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P01641 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P01641 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01641 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01641 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms