Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CopeO89079 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CopeO89079 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CopeO89079 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CopeO89079 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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