Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Hcn2O88703 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hcn2O88703 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hcn2O88703 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hcn2O88703 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms