Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnal1O88327 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnnal1O88327 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms