Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb5O70309 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb5O70309 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms