Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AurkbO70126 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AurkbO70126 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms