Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cbx4O55187 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cbx4O55187 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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