Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rpl35aO55142 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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