Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc3O55013 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc3O55013 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms