Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Cldn5O54942 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Cldn5O54942 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn5O54942 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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