Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjd2O54851 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjd2O54851 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms