Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChkaO54804 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms