Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DffaO54786 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DffaO54786 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DffaO54786 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DffaO54786 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms