Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snap23O09044 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snap23O09044 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms