Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncoa3O09000 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ncoa3O09000 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms